Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NubplQ9CWD8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms