Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smc3Q9CW03 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms