Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Sycp2Q9CUU3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Sycp2Q9CUU3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.3
Sycp2Q9CUU3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.3
Sycp2Q9CUU3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Sycp2Q9CUU3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Sycp2Q9CUU3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Sycp2Q9CUU3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Sycp2Q9CUU3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Sycp2Q9CUU3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Sycp2Q9CUU3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Sycp2Q9CUU3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Sycp2Q9CUU3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Sycp2Q9CUU3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Sycp2Q9CUU3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Sycp2Q9CUU3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Sycp2Q9CUU3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Sycp2Q9CUU3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Sycp2Q9CUU3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Sycp2Q9CUU3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
Sycp2Q9CUU3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Sycp2Q9CUU3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Sycp2Q9CUU3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Sycp2Q9CUU3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Sycp2Q9CUU3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Sycp2Q9CUU3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Sycp2Q9CUU3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Sycp2Q9CUU3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Sycp2Q9CUU3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Sycp2Q9CUU3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Sycp2Q9CUU3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Sycp2Q9CUU3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Sycp2Q9CUU3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Sycp2Q9CUU3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
Sycp2Q9CUU3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Sycp2Q9CUU3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Sycp2Q9CUU3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms