Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms