Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d3Q9CSV6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms