Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CRC3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CRC3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CRC3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9CRC3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRC3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRC3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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