Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc43Q9CR29 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms