Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI9

Med30, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med30Q9CQI9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Med30Q9CQI9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med30Q9CQI9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med30Q9CQI9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med30Q9CQI9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med30Q9CQI9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med30Q9CQI9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med30Q9CQI9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med30Q9CQI9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med30Q9CQI9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med30Q9CQI9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med30Q9CQI9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med30Q9CQI9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med30Q9CQI9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med30Q9CQI9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med30Q9CQI9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med30Q9CQI9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med30Q9CQI9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med30Q9CQI9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med30Q9CQI9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med30Q9CQI9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med30Q9CQI9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med30Q9CQI9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med30Q9CQI9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med30Q9CQI9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med30Q9CQI9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Med30Q9CQI9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med30Q9CQI9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med30Q9CQI9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med30Q9CQI9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med30Q9CQI9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med30Q9CQI9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med30Q9CQI9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med30Q9CQI9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med30Q9CQI9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med30Q9CQI9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms