Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Atp6v0e1Q9CQD8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Atp6v0e1Q9CQD8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Atp6v0e1Q9CQD8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Atp6v0e1Q9CQD8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Atp6v0e1Q9CQD8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6v0e1Q9CQD8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6v0e1Q9CQD8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Atp6v0e1Q9CQD8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Atp6v0e1Q9CQD8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Atp6v0e1Q9CQD8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Atp6v0e1Q9CQD8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
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Atp6v0e1Q9CQD8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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