Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA0

Cenpm, Centromere protein M, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpmQ9CQA0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CenpmQ9CQA0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CenpmQ9CQA0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CenpmQ9CQA0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CenpmQ9CQA0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CenpmQ9CQA0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CenpmQ9CQA0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CenpmQ9CQA0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CenpmQ9CQA0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CenpmQ9CQA0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CenpmQ9CQA0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CenpmQ9CQA0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CenpmQ9CQA0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpmQ9CQA0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms