Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
StambpQ9CQ26 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms