Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPP0

Npm3, Nucleoplasmin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm3Q9CPP0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Npm3Q9CPP0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Npm3Q9CPP0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms