Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU7

Bap1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap1Q99PU7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bap1Q99PU7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms