Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim26Q99PN3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms