Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NsmfQ99NF2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms