Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms