Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms