Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp5lQ99LH9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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