Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RtcbQ99LF4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RtcbQ99LF4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms