Protein–RNA interactions for Protein: Q99L43

Cds2, Phosphatidate cytidylyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds2Q99L43 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms