Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pagr1aQ99L02 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms