Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms