Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ciao1Q99KN2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ciao1Q99KN2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms