Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn2aQ99KJ0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms