Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms