Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH7

Clstn3, Calsyntenin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3Q99JH7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Clstn3Q99JH7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms