Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc8b1Q925Q3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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