Protein–RNA interactions for Protein: Q924T3

Xrcc4, DNA repair protein XRCC4, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc4Q924T3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Xrcc4Q924T3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms