Protein–RNA interactions for Protein: Q924D0

Rtn4ip1, Reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4ip1Q924D0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtn4ip1Q924D0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtn4ip1Q924D0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtn4ip1Q924D0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtn4ip1Q924D0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtn4ip1Q924D0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtn4ip1Q924D0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtn4ip1Q924D0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtn4ip1Q924D0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtn4ip1Q924D0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtn4ip1Q924D0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtn4ip1Q924D0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtn4ip1Q924D0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtn4ip1Q924D0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtn4ip1Q924D0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtn4ip1Q924D0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtn4ip1Q924D0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtn4ip1Q924D0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtn4ip1Q924D0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtn4ip1Q924D0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtn4ip1Q924D0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtn4ip1Q924D0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtn4ip1Q924D0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtn4ip1Q924D0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtn4ip1Q924D0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtn4ip1Q924D0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtn4ip1Q924D0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtn4ip1Q924D0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtn4ip1Q924D0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtn4ip1Q924D0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms