Protein–RNA interactions for Protein: Q923K4

Gtpbp3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp3Q923K4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp3Q923K4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms