Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms