Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Sh3bp4Q921I6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Sh3bp4Q921I6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sh3bp4Q921I6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp4Q921I6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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