Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TardbpQ921F2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TardbpQ921F2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms