Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms