Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP9

Necab2, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab2Q91ZP9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Necab2Q91ZP9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Necab2Q91ZP9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Necab2Q91ZP9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Necab2Q91ZP9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Necab2Q91ZP9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Necab2Q91ZP9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Necab2Q91ZP9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Necab2Q91ZP9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Necab2Q91ZP9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Necab2Q91ZP9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Necab2Q91ZP9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Necab2Q91ZP9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Necab2Q91ZP9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Necab2Q91ZP9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Necab2Q91ZP9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Necab2Q91ZP9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Necab2Q91ZP9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Necab2Q91ZP9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Necab2Q91ZP9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Necab2Q91ZP9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms