Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z40

Gbp7, Gbp6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp7Q91Z40 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp7Q91Z40 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp7Q91Z40 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp7Q91Z40 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp7Q91Z40 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp7Q91Z40 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp7Q91Z40 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp7Q91Z40 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp7Q91Z40 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp7Q91Z40 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp7Q91Z40 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp7Q91Z40 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp7Q91Z40 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp7Q91Z40 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp7Q91Z40 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp7Q91Z40 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp7Q91Z40 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp7Q91Z40 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp7Q91Z40 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp7Q91Z40 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp7Q91Z40 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp7Q91Z40 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp7Q91Z40 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp7Q91Z40 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp7Q91Z40 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp7Q91Z40 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp7Q91Z40 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms