Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc49Q91YK0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms