Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atl3Q91YH5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms