Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Synpo2Q91YE8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Synpo2Q91YE8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.7 ms