Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcdhb12Q91Y07 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms