Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Creb3l3Q91XE9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Creb3l3Q91XE9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms