Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms