Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Odf4Q8VI88 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms