Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD75

Hip1, Huntingtin-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hip1Q8VD75 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hip1Q8VD75 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hip1Q8VD75 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hip1Q8VD75 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hip1Q8VD75 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hip1Q8VD75 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Hip1Q8VD75 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hip1Q8VD75 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hip1Q8VD75 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hip1Q8VD75 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hip1Q8VD75 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hip1Q8VD75 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hip1Q8VD75 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hip1Q8VD75 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hip1Q8VD75 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hip1Q8VD75 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hip1Q8VD75 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hip1Q8VD75 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hip1Q8VD75 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hip1Q8VD75 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hip1Q8VD75 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hip1Q8VD75 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hip1Q8VD75 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hip1Q8VD75 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hip1Q8VD75 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hip1Q8VD75 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms