Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt25Q8VCW2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms