Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk8Q8R3L8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk8Q8R3L8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk8Q8R3L8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk8Q8R3L8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk8Q8R3L8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk8Q8R3L8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk8Q8R3L8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk8Q8R3L8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk8Q8R3L8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk8Q8R3L8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cdk8Q8R3L8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdk8Q8R3L8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms