Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3F9

Tut1, Speckle targeted PIP5K1A-regulated poly(A) polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tut1Q8R3F9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tut1Q8R3F9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tut1Q8R3F9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tut1Q8R3F9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tut1Q8R3F9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tut1Q8R3F9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tut1Q8R3F9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tut1Q8R3F9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tut1Q8R3F9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tut1Q8R3F9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tut1Q8R3F9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tut1Q8R3F9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tut1Q8R3F9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tut1Q8R3F9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tut1Q8R3F9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tut1Q8R3F9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tut1Q8R3F9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tut1Q8R3F9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tut1Q8R3F9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tut1Q8R3F9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tut1Q8R3F9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tut1Q8R3F9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tut1Q8R3F9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms