Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnaaf4Q8R368 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnaaf4Q8R368 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms