Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc12Q8R344 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms