Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.5 ms